Да, вы можете в настройках интеграции с КАД, указать, как система должна себя вести по делам с участием вашей организации в зависимости от роли этой организации в деле. Например, можно настроить чтобы автоматически создавались новые карточки только по тем делам, где ваша организация ответчик, а в остальных случаях направлять уведомления, не создавая при этом карточки дела.